蛋白质相互作用网络中信号流向方向预测；根据网络的拓扑性质，挖掘网络重要节点（如hub节点，crosstalk节点）；根据功能信息注释，进行网络模块化

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iTRAQ/TMT蛋白组定量分析 SILAC蛋白组定量分析  Label Free非标定量分析  半定量分析（spectral count）    鸟枪法蛋白全谱分析  2D蛋白胶点鉴定   单一蛋白高覆盖度分析

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水稻胚乳细胞特异性高效表达技术平台可以实现蛋白质和多肽表达技术服务，包括构建载体、获得高效表达、遗传学稳定的转基因品系；同时也可以提供蛋白质和多肽的下游纯化、小试或中试工艺开发等技术服务。

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服务项目包括样本制备、双向电泳、图像分析、胶内酶切、蛋白质鉴定、数据库查询与结果分析、免疫印迹。

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在质谱图中，任何一种iTRAQ试剂标记的不同样本中的同一蛋白质表现为相同的质荷比。而在串联质谱中，信号离子表现为不同质荷比(114～117)的峰，因此，根据波峰的高度及面积，可以得到蛋白质的定量信息。

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