DfCell支原体快速检测试剂盒(qPCR)-细胞/细菌培养-试剂-生物在线
上海魔兜儿生物科技有限公司
DfCell支原体快速检测试剂盒(qPCR)

DfCell支原体快速检测试剂盒(qPCR)

商家询价

产品名称: DfCell支原体快速检测试剂盒(qPCR)

英文名称: DfCell Mycoplasma qPCR Detection Kit

产品编号: C230106

产品价格: null

产品产地: 美国

品牌商标: Arcegen

更新时间: 2024-12-11T17:12:11

使用范围: null

规格 价格
25T 3699.0
100T 12949.0
上海魔兜儿生物科技有限公司
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产品简介

MycAway™ 支原体 qPCR 检测试剂盒(探针法)是基于 NAT(nucleic acid amplification techniques)的一种快速定性检测生产原料、细胞库、病毒种子、病毒或细胞收获液、治疗用细胞中潜在支原体污染的产品。该试剂盒基于定量 PCR 技术,采用多重 PCR 的方法,使用 2 种荧光探针,FAM 和 VIC,分别检测目标序列和内参。可覆盖 100 多种支原体 DNA 序列;并且严格按照 EP 2.6.7 进行专属性、检测限、耐用性验证,检测限满足≤10 CFU/mL 的要求,具备灵敏度高、特异性好、安全性好等特点。

本产品能够与利用手动提取方法的 MolPure® 磁珠法残留 DNA 样本前处理试剂盒(Cat#18461)搭配使用。样本中的核酸同样也可以使用 Auto-Pure 32A 全自动核酸提取仪(Cat#80501)和 MolPure® 磁珠法残留DNA 样本前处理试剂盒 FA(预封装)(Cat#18462)自动提取样本核酸(请注意,试剂盒货号 Cat#18461 和 Cat#C230106 都已经过完全验证,如需详细验证信息,可以联系我司技术支持)。样本经过前处理去除干扰杂质获得纯化的支原体 DNA 后,使用qPCR 仪进行 qPCR 反应后收集探针的荧光信号,从而对检测结果进行分析。

产品规格

货号

C230106E / C230106S

规格

25 T / 100 T

组分信息

组分编号

组分名称

C230106E

C230106S

C230106-A

4×MyqPCR Reaction Buffer

250 μL

1 mL

C230106-B

MyPrimer & Probe MIX

25 μL

100 μL

C230106-C

内部对照(IC)

25 μL

100 μL

C230106-D*

阳性对照(PCS)

500 μL

2 mL

C230106-E**

DNA 稀释液

1 mL

4×1 mL

C230106-F***

超纯水

500 μL

2×1 mL

* 内部对照(IC):Internal control;

** 阳性对照(PCS):Positive control solution,浓度为 1,000 copies/µL;

*** DNA 稀释液:用于样本和 IC 稀释、以及 NTC 和 NCS 的模板;

**** 超纯水:用于制备 qPCR Mix 体系。

运输与储存

25~-15℃保存,有效期 1 年。

*收到货后,请检查各组分是否齐全,如不立即开封各组分做实验,需立即放入-25~-15℃中保存。注意 C230106-B 需要避光保存。

使用说明

1.实验前准备

1)提前准备实验所需试剂耗材;

2)确认仪器适配性:

本试剂盒适配的 qPCR 机型包含但不限于以下仪器:

A:Bio-Rad: CFX96

B:Thermo Scientific: 7500 Real-Time PCR System;QuantStudio™ 5;

2.实验方法

1)待测样本 DNA 提取

建议使用 Arcegen 的“磁珠法残留 DNA 样本前处理试剂盒”提取样本 DNA,产品货号为 Cat#18461ES(用于手动提取)和Cat#18462ES(用于自动提取),您可以在Arcegen官网查询该产品的详细信息和购买该产品。本试剂盒(Cat#C230106ES)中包含内部对照(IC)。如果在 DNA 提取前将 IC 加入样品中,可以验证整个过程(包括 DNA提取和 qPCR 反应)。如果将 IC 直接添加到qPCR Mix 中,IC 将仅作为 qPCR 对照。

2)qPCR 反应体系的准备

a.根据所要检测样本的数量,包括阳性对照(PCS),无模板对照(NTC),抽提阴性对照(NCS)和待测样本(TS),  根据实验设计,计算所需反应孔数,一般每个样本做 2 个重复孔。

*阳性对照(PCS):Positive control solution;无模板对照(NTC):No template control;抽提阴性对照(NCS):Negative control solution;

待测样本(TS):Test sample。PCS 和 NTC 为无需进行提取前处理的样本;NCS 和 TS 为需要进行提取前处理的样本。

反应孔数(M1)=(1×NCS + N×TS)×2

反应孔数(M2)=(1×PCS + 1×NTC)×2

反应孔数(M3)=(1×PCS + 1×NTC+ N×TS)×2

b.根据实验设计以及下面对应表格中的反应体系,提前将所需试剂放置冰上融化。

c.根据反应孔数计算所需要的qPCR Mix 的量。注意,如果使用该产品用于产品放行等 GMP 活动中,则推荐按照表 1 和表 2 配置体系;如果仅用于研发实验中,用户自行评估实验情况后认为无需提取前将IC 加入 TS 中或无需做 NCS 对照,也可按照表 3 配置体系。并非 M1,M2,M3都需要配制。

组分

体积(1×40μL 反应体系)

体积(M1×40μL)

4× MyqPCR Reaction Buffer

10 μL

(M1+2) ×10 μL

MyPrimer & Probe MIX

1 μL

(M1+2) ×1 μL

ROX

0.8 μL /0 μL**

(M1+2) ×0.8 μL /0 μL

超纯水

Up to 20 μL

Up to (M1+2) ×20 μL

Total

20 μL

(M1+2) ×20 μL

表 1 反应孔数(M1)对应的 qPCR Mix 体系

*表 1 中的配置体系是基于 NCS 和 TS 都是在提取前加入 IC 的前提下,则无需在配置 qPCR Mix 时再加入 IC。提取前加入 IC 的方法:首先将试剂盒 IC 用 DNA 稀释液稀释 20 倍,每 100 μL 检测样本加入 1 μL 稀释后的 IC 后进行提取。

**本试剂盒不含 ROX 参比染料,若您目前使用的 Real Time PCR 扩增仪需要添加 ROX 参比染料,推荐您购买本公司的 50× ROX Reference Dye

(Cat#10200ES),以使用本产品为例,添加体积为 0.8 μL,见表 1。如果使用其他品牌的 ROX 产品,请具体参考其说明书进行 ROX 添加。若不需要添加 ROX 参比染料,则添加体积为 0 μL。

组分

体积(1×40μL 反应体系)

体积(M2×40μL)

4× MyqPCR Reaction Buffer

10 μL

(M2+2) ×10 μL

MyPrimer & Probe MIX

1 μL

(M2+2) ×1 μL

 

组分

体积(1×40μL 反应体系)

体积(M2×40μL)

内部对照(IC)

1 μL*

(M2+2) ×1 μL /0 μL

ROX

0.8 μL /0 μL**

(M2+2) ×0.8 μL /0 μL

超纯水

Up to 20 μL

Up to (M2+2) ×20 μL

Total

20 μL

(M2+2) ×20 μL

表 2 反应孔数(M2)对应的 qPCR Mix 体系

 

*表 2 中的配置体系是基于 PCS 和 NTC 都是未在提取前加入 IC 的前提下,则需要在配置 qPCR Mix 时加入 IC。提取后加入 IC 的方法:将 IC 用 DNA稀释液稀释 100 倍后每个反应体系中加 1 μL。

**本试剂盒不含 ROX 参比染料,若您目前使用的 Real Time PCR 扩增仪需要添加 ROX 参比染料,推荐您购买本公司的 50× ROX Reference Dye

(Cat#10200ES),以使用本产品为例,添加体积为 0.8 μL,见表 2。如果使用其他品牌的 ROX 产品,请具体参考其说明书进行 ROX 添加。若不需要添加 ROX 参比染料,则添加体积为 0 μL。

 

组分

体积(1×40μL 反应体系)

体积(M3×40μL)

4× MyqPCR Reaction Buffer

10 μL

(M3+2) ×10 μL

MyPrimer & Probe MIX

1 μL

(M3+2) ×1 μL

内部对照(IC)

1 μL*

(M3+2) ×1 μL /0 μL

ROX

0.8 μL /0 μL**

(M3+2) ×0.8 μL /0 μL

超纯水

Up to 20 μL

Up to (M3+2) ×20 μL

Total

20 μL

(M3+2) ×20 μL

表 3 反应孔数(M3)对应的 qPCR Mix 体系

 

*表 3 中的配置体系是基于提取前样本中不加入 IC 的前提下,则需要在配置 qPCR Mix 时加入 IC。提取后加入 IC 的方法:将 IC 用 DNA 稀释液稀释 100 倍后每个反应体系中加 1 μL。

**本试剂盒不含 ROX 参比染料,若您目前使用的 Real Time PCR 扩增仪需要添加 ROX 参比染料,推荐您购买本公司的 50× ROX Reference Dye

(Cat#10200ES),以使用本产品为例,添加体积为 0.8 μL,见表 3。如果使用其他品牌的 ROX 产品,请具体参考其说明书进行 ROX 添加。若不需要添加 ROX 参比染料,则添加体积为 0 μL。

3)加样

A.充分震荡混匀 qPCR Mix,低速离心,将管盖残留液体收集至管底。

B.向每孔反应管中分装 20μL 对应样本的 qPCR Mix。注意,各样品管中分装的 qPCR Mix 需要与上一步“qPCR 反应体系的准备”中配置的 qPCR Mix 保持一致,与样品一一对应,避免加错。

 C.向已分装过qPCR Mix 的反应管中加入样品,参考表 4。

样本

向每管或孔中加入…

TS

20 μL qPCR Mix+20 μL 待测样本纯化液

NTC

20 μL qPCR Mix+20 μL DNA 稀释液

NCS*

20 μL qPCR Mix+20 μL NCS 纯化液*

PCS

20 μL qPCR Mix +20 μL 阳性对照

**每管或孔中最终反应体积为 40μL。

*NCS 推荐使用 DNA 稀释液作为样本进行前处理。

表 4 加样示例

***注意盖上反应管盖子或者贴上光学膜,为避免影响荧光信号读取,请注意不要在管盖或者膜上做标记,或者用刮板反复摩擦。

****完成加样后,先短时低速离心反应管或反应板,再充分震荡混匀然后短时低速离心,将管盖和管壁的残留液体收集至管或板底。操作时尽量避免气泡产生。这一步非常重要,不混匀或者混匀不彻底会影响基线平稳。

4)qPCR 程序参数设置

A.程序文件设置:

以 Thermo Scientific: 7500 Real-Time PCR System 仪器和 Real-Time PCR Software v2.4 为例:仪器类型:7500 (96 Wells)

实验类型选择:Quantitation-Standard Curve;检测目标序列的试剂:Taqman® Reagents

程序速度:Standard (~2 hours to complete a run)

B.检测通道设置:

在“Plate Setup”的“Define Targets and Samples”中,创建 Target 1 通道(FAM),选择报告荧光基团为FAM,猝灭荧光基团为 MGB 或none;创建 Target 2 通道(VIC),选择报告荧光基团为 VIC,猝灭荧光基团为 none。在“Plate Setup”   的“Assign Targets and Samples”中,如果没有额外加入 ROX 染料,则选择“none”;如果额外加入了 ROX,则选择“ROX”。

c. 标准扩增程序设置:

编号

反应阶段

温度

时间

循环数

1

预变性

95℃

5 min

1

2

变性

95℃

15 sec

45

3

退火/延伸(荧光信号收集)

62℃

30 sec

 

表 5 标准扩增程序

d. 基线和阈值设置:

基线调整原则:基线通常按照自动设置的基线即可。如需手动调整,基线起始循环数选择在指数增长期之前,其中起点设置需要避开起始荧光采集的波动区,终点选择在最早出现指数扩增样本的 Ct 值的前 1-2 个循环。

阈值设置原则:通常采用自动阈值。如需手动调整,阈值线要高于阴性对照或者基线噪音,通常设置在样本重复性较好的指数增长期的后期,不同通道需要设置相对独立的、合适的阈值线。

5)结果分析

a.PCS、NTC 和NCS 结果判断:

若反应体系中加入了 IC,则各质控样品需要满足表 6 中条件:

质控样本

FAM 信号

VIC 信号

PCS

Ct < 40,且有明显的扩增曲线

Ct < 40,且有明显的扩增曲线

NTC

Ct ≥ 40,或无明显的起峰

Ct < 40,且有明显的扩增曲线

NCS

Ct ≥ 40,或无明显的起峰

Ct < 40,且有明显的扩增曲线

表 6 PCS、NTC 和 NCS 结果判断

若反应体系中未加 IC:各质控样品需要满足表 6 中 FAM 信号一列的条件,无需分析 VIC 通道。

b.待测样本 TS 检测结果判断:

前提条件:判断样本 TS 检测结果前,需要先判断各质控品即 PCS、NTC 和 NCS 是否通过表 6 中的标准。若通过则可以进行下一步;若未通过,则样本 TS 的结果可能不可靠,需要调查原因。

若反应体系中加入了 IC,则根据样本FAM 信号和 VIC 信号的结果找到表 7 中对应的结果判断:

FAM 信号

VIC 信号

结果判断

Ct<40 ,且有明显的扩增曲线

Ct<40 ,且有明显的扩增曲线

阳性

 

Ct≥40 ,或无明显的起峰

有抑制,需要重复实验*

FAM 信号

VIC 信号

结果判断

Ct≥40 ,或无明显的起峰

Ct<40 ,且有明显的扩增曲线

阴性

 

Ct≥40 ,或无明显的起峰

有抑制,需要重复实验*

表 7 待测样本结果判断(加 IC 时)

*VIC 信号如果有抑制,需重测或对样本进行合适处理消除抑制因子

若反应体系中未加 IC:无需分析 VIC通道,只需要根据表8中样本FAM信号的结果找到对应的结果判断:

FAM 信号

结果判断

Ct<40 ,且有明显的扩增曲线

阳性

Ct≥40 ,或无明显的起峰

阴性

表 8 待测样本结果判断(未加 IC时)

注意事项

1)使用本试剂前请仔细阅读本说明书,实验应规范操作,包括样本处理、反应体系的配制及加样。

2)加样和配液步骤都尽量在冰上操作。

3)每个组分在使用前都应震荡混匀,低速离心。

4)为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

5)本产品仅作科研用途。