C Braconi, et al., MicroRNA-29 can regulate expression of the long non-coding RNA gene MEG3 in hepatocellular cancer. Oncogene (2011) 1–7.
研究者采用Arraystar lncRNA 芯片，比较HCC细胞株和良性人肝细胞的lncRNA表达水平，找到了在HCC细胞中表达显著下调的lncRNA MEG3 (the maternally expressed gene-3），并进行了实时定量PCR的验证。对肝癌组织和癌旁肝硬化组织的实时定量PCR实验，以及对非肿瘤肝组织和HCC组织的ISH实验，同样发现MEG3在肝癌中的特异性表达下调。体外细胞实验初步研究了MEG3的肿瘤抑制功能，包括对细胞生长和细胞凋亡的调控等。而对MEG3自身所受到的表达调控机制的研究，则提示MEG3的表达下调可能是因为MEG3启动子发生了超甲基化，即lncRNA的表达同样可能受到表观遗传调控；而MEG3启动子的超甲基化可能是microRNA-29a 调控通路作用的结果，从而将两类重要的非编码RNA，microRNA和lncRNA联系了起来。
表. 利用arraytar lncRNA芯片分析良性人肝细胞和4种不同HCC细胞株的lncRNA表达水平。表格中分别列出了与良性人肝细胞相比，在HCC中表达变化最大（下调或上调）的10条lncRNA